Da ich nur ein Depot habe, ist mir dieses Phänomen nicht aufgefallen. Ich gehe aber davon aus, dass sich die Unterschiede durch andere Handelsplätze erklären lässt. Nicht, weil pro Depot eine "personalisierte" Priorisierung des Handelsplatzes stattfindet, sondern durch den unterschiedlichen Zeitpunkt des Aufrufs des jeweiligen Depots.
Wenn ich das in meinem Depot richtig interpretiere, wird der gewählte Handelsplatz anhand der letzten Kursstellung genommen. Vermutlich gibt es auch ein "default" Handelsplatz, wenn es an mehreren Handelsplätzen neue Kurse gibt. Wenn du Depot 1 aufrufst und dort 5 Min drin bist, könnte beim Aufruf von Depot 2 eine erneute Kursabfrage stattfinden, was zu einem Wechsel des Handelsplatzes führen könnte.
Wenn du die Möglichkeit hast, könntest du es versuchen mit der Webversion nachzustellen ob meine Vermutung korrekt ist.