Ich würde generell Langzeitanlagen vom Daytrading durch ein zweites Depot trennen. So verhindert man, dass man aus Versehen etwas verkauft, dass eigentlich für die Langfristanlage gedacht war oder aus steuerlichen Gründen vielleicht besser nicht verkauft werden sollte.
Mit einem zweiten Depot hättest du auch gleich ein zweites Verrechnungskonto und somit auch die Barmittel sauber getrennt.
Steuerlich spielt es keine Rolle ob man in einem Depot langfsitige Anlagen hält und nebenbei noch daytradet. Ausnahme Wertpapere aus Altbeständen.