Ich nutze auch MoneyMoney und hatte das gleicheProblem, Grund ist das einmal der Kontostand abgefragt & einmal die Kontoauszüge geladen werden da es wohl zwei Server bzw. Abfragen sind.
Klicke auf Kontoauszüge, dann oben rechts auf Einstellungen für Kontoauszüge und änder den Automatischen Abruf auf am Monatsanfang ab (ich denke das bei dir einmal am Tag steht) und schon sollten alle Konten & Depots mit einer Secure Tan aktualisiert werden können.